分子育種技術研究室是用基因組測序和基因組編輯等現代分子生物學技術對多農業生物的遺傳信息進行解讀和編輯以達到創新利用的實驗室。
主要研究領域：
分子育種技術研究室通過對農業生物進行高通量測序，並輔之以轉錄組、蛋白組和代謝組等其它組學數據，采用全基因組關聯分析，從而挖掘農業生物中高產、優質和抗逆基因；再通過全基因組選擇和基因組編輯技術，在生產上主推品種中精準和快速引入這些高產、優質和抗逆基因，從而創立農業生物新種質或新品種。目前的主要研究有：水稻、蘑菇、稻瘟病菌、豬等基因組測序和基因組編輯育種；水稻耐冷研究；大豆基因組編輯育種研究；薏苡和油菜傳統育種或基因組編輯育種。