近日，作物所科技人員在著名期刊《Horticulture Reaearch》（TOP1區，IF5.404）上發表了高質量南藥巴戟天基因組研究成果，成功組裝巴戟天染色體級高質量基因組。作物所王繼華研究員、徐世強博士為共同第一作者。
　　巴戟天具有1700餘年藥用曆史，是我國著名的“四大南藥”之一。廣東省的巴戟天栽培麵積最大，產量占全國總產量的90%以上，曆史道地產區在我省肇慶市，其中高要巴戟天獲得國家“道地藥材”和“中華人民共和國地理標誌保護產品”認證。揭示中藥材的道地性一直以來是南藥領域的研究熱點。長期以來，高質量的巴戟天基因組圖譜的缺乏製約了其功能基因組學和分子育種的發展，本研究將為巴戟天的遺傳改良以及活性成分的合成調控提供了重要的理論基礎。
　　近年來，作物特色作物與南藥研究室在“院人才培養基金”及“所長基金”等資助下啟動了以巴戟天為代表的“道地南藥基因組計劃”。本次與亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室、廣西大學等多家單位和企業聯合，采用Oxford Nanopore三代測序（130X）和Hi-C 技術（115X）對廣東省高要市主要栽培品種“高戟3號”進行測序，首次組裝巴戟天染色體級高質量基因組。組裝的參考基因組大小為484.85 Mb，雜合度為1.32%，contig N50為4.21 Mb,scaffold N50為40.97 Mb，BUSCO指數為97.02%，注釋獲得27,102個蛋白質編碼基因。同時，本研究還對蒽醌類、環烯醚萜類和多糖類成分生物合成的結構基因的表達模式進行了分析。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41438-021-00551-w