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我所與中國農科院深圳基因組所合作解析薑荷花重要性狀遺傳機製

時間:2022-10-09 17:29 來源: 【字體:

近日,環藝所特色花卉研究室與中國農科院深圳基因組所(簡稱基因組所)合作完成的研究論文“The genomic and bulked segregant analysis ofCurcuma alismatifoliarevealed its diverse bract pigmentation”發表在aBIOTECH期刊。基因組所廖雪竹博士環藝所葉遠俊博士基因組所張曉妮博士為論文的共同第一作者環藝所朱根發研究員和基因組所武誌強研究員為論文的通訊作者。

薑荷花(Curcuma alismatifoliaGagnep.)又稱熱帶鬱金香Summer tulip)、暹羅鬱金香Siam tulip),是薑科薑黃屬的新興熱門切花,具有重要的藥用、觀賞價值和市場應用潛力。作為薑荷花最重要的觀賞性狀,苞片顏色受到育種家和研究者越來越多的關注,解析薑荷花苞片顏色形成的機製,將為這種新的觀賞花卉的開發提供理論參考,同時為薑荷花精準高效的分子設計育種奠定基礎。

研究團隊利用三代HiFi、二代MGIHi-C數據,對薑荷花栽培品種清邁粉進行了全基因組測序和組裝。研究發現薑荷花與薑科植物薑大約在1,190萬年前發生了分化,並經曆了一次薑科共有的全基因組加倍事件利用清邁粉和具有純白不育苞片的品種鄉村雪的不同組織部位和發育時期進行轉錄組測序,確定了薑荷花產生不同顏色苞片的關鍵基因。同時通過集團分離分析法(BSA)定位到同樣的F3'5'H基因,發現薑荷花苞片顏色性狀在群體水平發生分化,其可育苞片和不育苞片的形態和顏色在不同品種間差異巨大。這項工作為了解薑荷花苞片顏色形成的機製打下了基礎,並對培育具有豐富苞片顏色的薑荷花新品種起到重要的促進作用。

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