我所在花葉芋葉片重要觀賞性狀 關聯分析和葉綠體基因組方麵取得新進展
時間:2022-12-15 10:13
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近日,環藝所特色花卉研究室在國際期刊Physiologia Plantarum(中科院2區,IF=5.081)發表題為“Diversity, classification, and EST-SSR-based association analysis of Caladium ornamental traits”的研究論文,環藝所周熠瑋博士和葉遠俊博士為論文的共同第一作者,環藝所劉金梅副研究員為論文的通訊作者。在Genes(中科院3區,IF=4.141)發表題為“Complete Chloroplast Genome Sequences of Four Species in theCaladiumGenus: Comparative and Phylogenetic Analyses”的研究論文,環藝所葉遠俊博士為論文的第一作者,環藝所徐曄春研究員為論文的通訊作者。
花葉芋(Caladium×HortulanumBirdsey),是天南星科花葉芋屬多年生草本植物,被譽為“觀葉皇後”。花葉芋資源豐富,表型性狀變異豐富,國內外主要集中在栽培育種、組培快繁、標記開發等研究,關於葉片重要觀賞性狀的關聯分析和基於葉綠體基因組學的係統發育研究還未見報道。
研究團隊對144份花葉芋種質的葉片12個主要觀賞性狀進行了觀測,利用26個多態性好的SSR標記對144份種質進行基因分型,群體結構分析表明144份材料可分為三個組,且與品種的地理來源顯著相關。對標記分型數據和主要觀賞性狀表型數據進行了關聯分析,鑒定出2、1、1、1、1和1個SSR標記分別與葉柄顏色、主脈顏色、葉片光澤以及葉片顏色的C、b*和L*顯著相關(p)。這些與性狀關聯的位點為花葉芋的分子標記輔助選擇育種奠定了基礎。
研究以4個不同花葉芋原生種(Caladium bicolor、Caladium humboldtii、Caladium praetermissum和Caladium lindenii)為材料,利用高通量測序對其葉綠體基因組進行測序、組裝和注釋,並分析葉綠體基因組IR邊界、間隔區信息位點的特征,研究遺傳多樣性和係統發育關係,為花葉芋的種質資源的鑒定、開發和利用提供一定的理論依據。
該兩項工作獲得國家留學基金項目、必威betways 協同創新中心項目和廣東省省級科技計劃項目資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1111/ppl.13841
https://www.mdpi.com/2073-4425/13/12/2180