近日，必威betways 果樹研究所聯合北京大學現代農業研究院等多家單位合作撰寫的題為“Genomic insights into longan evolution from a chromosome-level genome assembly and population genomics of longan accessions” 的研究論文在《Horticulture Research》（中科院大類一區，Impact Factor=6.793）在線發表。果樹所王靜博士和李建光研究員為論文共同第一作者，北京大學現代農業研究院郭立研究員和中國農業科學院深圳農業基因組研究所錢萬強研究員、果樹所李建光研究員為共同通訊作者。
該論文結合單分子測序技術和染色體構象捕捉技術, 完成了龍眼栽培品種“雞蛋本”的基因組序列破譯工作，獲得了染色體級別的龍眼參考基因組。本次發布的龍眼基因組序列大小為455.5Mb，Contig N50達到了12.1 Mb，BUSCO分析結果顯示基因組完整性為98.1%。Hi-C輔助組裝技術組裝到染色體水平基因組（圖1a）。基因家族鑒定及分析結果表明，龍眼中的苯丙烷類生物合成相關基因家族數量擴增。

龍眼的基因組學和種群結構分析

通過對87個龍眼種質基因組遺傳變異分析，發現龍眼群體表現出明顯的地理結構，揭示了不同地理起源品種間明顯的群體混合和滲入現象，推測龍眼可能的遷徙軌跡。利用高質量基因組和豐富的遺傳材料，研究人員進行了GWAS分析，鑒定了6個與果實品質顯著相關的數量性狀基因座（QTL），發現了3個潛在控製可溶性固形物和種子重量的QTLs位點。高質量的基因組組裝、注釋和進化分析對龍眼的功能基因組研究和分子育種具有重要價值，為提高龍眼產量、果實品質和開發龍眼的藥用價值奠定了堅實的分子理論基礎。

GWAS關聯分析龍眼種子大小與果實可溶性

固形物含量性狀