果樹所在特色香蕉種質的基因組研究方麵取得新進展
2023年9月1日,Cell旗下期刊《Plant Communications》(生物學1區top,IF=10.5)在線發表了果樹所香蕉遺傳改良團隊與廣西大學陳玲玲教授團隊合作的題為“High-quality reference genome assemblies for two Australimusa bananas provide insights into genetic diversity of the Musaceae family and regulatory mechanisms of superior fiber properties”的研究論文。果樹所為論文的第一完成單位,我院易幹軍副院長、盛鷗研究員和陳玲玲教授為論文的共同通訊作者,陳玲玲教授指導的博士研究生周潤、王朔和易幹軍研究員指導的博士後詹妮為論文共同第一作者。
香蕉種質資源的多樣性十分豐富,栽培香蕉中存在A、B、S、T基因組類型,前三者主要存在真蕉組(Enmusa,2n=22)的種質中,T基因組起源於澳蕉組(Australimusa,2n=20)的種質。Australimusa代表性物種有纖維用途的Musa textilis(Abaca,麻蕉)和富含類胡蘿卜素的栽培類型Fe’i (Musa troglodytarum)。組裝高質量的香蕉TT基因組對深入研究芭蕉科植物的進化,解析蕉麻纖維性能形成及類胡蘿卜素積累的分子機製等具有重要作用。
該研究論文以2個澳蕉組(Australimusa)種質為材料,構建了高質量的香蕉TT參考基因組,探究了芭蕉科物種的基因組進化和全基因組複製事件,解析轉座子和染色體重排在基因組進化中的重要作用,最後基於基因組、比較轉錄組和生理生化實驗分析揭示了Abaca優異纖維性能的遺傳調控基礎。
本研究得到了國家重點研發計劃(2019YFD1000203、2019YFD1000900)、國家香蕉產業技術體係(CARS-31-01)等多個項目的資助。
論文連接:https://www.cell.com/plant-communications/fulltext/S2590-3462(23)00209-2
香蕉基因組結構和進化分析