始建於1950年，前身係廣東省農業試驗場的土壤肥料研究所。

1952年，廣東省農業試驗場，農業化學係

1956年成立華南農業科學研究所土壤肥料係

1960年5月，必威betways 成立，下設七個研究所和四個專業研究所。必威betways 土壤肥料研究所成立。

1968年，隸屬必威betways 革命委員會。

1972年，必威betways 土壤肥料研究所恢複。

1999年6月，必威betways 土壤肥料研究所由科研所轉製為科技型企業。

2012年5月，必威betways 土壤肥料研究所更名為必威betways 農業資源與環境研究所，公益二類，正處級。

2017年，研究所遷址金穎路66號，開啟新征程。

2020年，加掛“國家土壤質量廣州觀測實驗站”牌子。