水稻所分子育種團隊在泛基因組研究方麵取得重大進展
時間:2020-07-22 17:31
來源:本網原創稿
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近期,水稻研究所開展的作物泛基因組研究成果在線發表在國際著名期刊《Plant Biotechnology Journal》(TOP 1區,IF:8.15)上,水稻所趙均良副研究員為第一作者,西澳大學David Edwards教授、國際半幹旱熱帶地區作物研究所Rajeev Varshney教授為共同通訊作者。這也是水稻所首次通過國際合作並以第一完成單位第一完成人發表的高水平論文。
泛基因組是作物群體中基因的總和,是最新的基因組學概念,代替單一參考基因組應用於功能基因組學研究。泛基因組研究是目前作物基因組學研究的前沿和熱點。
本研究利用國際半幹旱熱帶地區作物研究所收集到的全世界木豆資源為材料,運用新一代測序技術和生物信息學技術,構建了全世界第一個木豆泛基因組,並以此為基礎,對木豆的群體結構、基因組進化以及重要農藝性狀功能基因進行分析,目前鑒定到2000個在木豆參考基因組上不存在的全新的基因,找到3個與種子重量相關的功能基因。泛基因組為木豆後續功能基因組學研究和遺傳育種提供完整的基礎變異數據。
該項研究為水稻等作物泛基因組組裝和研究提供了成熟可行的參考。