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動衛所在豬德爾塔冠狀病毒遺傳演化方麵取得新進展

時間:2022-04-02 09:29 來源:動衛所 【字體:

  近日,動衛所聯合華南農業大學等單位撰寫題為“Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans”的研究論文在獸醫權威期刊《Transboundary and Emerging Diseases》(Top一區期刊)在線發表(論文網址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503)。華南農業大學獸醫學院博士研究生李根、必威betways 動物衛生研究所翟少倫研究員、我院擬進站博士後周霞博士為論文共同第一作者,華南農業大學獸醫學院賀東生教授和陳瑞愛教授為共同通訊作者。

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  豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV),又名豬丁型冠狀病毒,是具有包膜的單股正鏈RNA病毒,與新冠肺炎病毒(SARS-CoV-2)同屬於冠狀病毒科,是已知RNA病毒中基因組最大的一類病毒。PDCoV於2012年首次在香港豬群中被發現。2014年在美國各大豬場暴發該病,並隨後流行於世界各地,包括我國(圖1)。之後,多篇動物試驗研究證實PDCoV可感染雞、火雞、犢牛等,並表現出輕度腹瀉症狀。2021年,Nature雜誌還發表了PDCoV感染海地兒童的論文。在新冠肺炎大流行期間,人類高度關注包括PDCoV在內的動物冠狀病毒跨物種傳播。

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圖1 PDCoV在世界的流行分布

  遺傳進化分析表明本研究分離的和已知的所有PDCoV毒株可分為中國譜係、美國譜係和東南亞等三大譜係(圖2);重建的PDCoV全球空間擴散網絡研究顯示PDCoV起源於1996年左右的亞洲,2007年左右傳播到美國,然後蔓延到東亞和南美洲,海地人感染的PDCoV最有可能源自美國(圖3、圖4)。

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圖2 PDCoV遺傳進化分析

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圖3 PDCoV全基因組的曆史演化分析

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圖4 PDCoV空間擴散

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