近日，我院蔬菜所何煥清研究員團隊與福建省農業科學院食用菌研究所陳體強研究員團隊合作完成白肉靈芝Ganoderma leucocontextumstrain H4的全基因組測序、組裝與注釋分析。該項目從雙核菌絲體提取高質量的總DNA，采用Nanopore三代測序，組裝得到的基因組由66條無gap的Scaffold構成，序列總長54.027Mb；用於組裝糾正的二代測序數據（5,800Mb，Illumina Hiseq）覆蓋率達98.98%，BUSCO評估基因組完整性 BUSCOs (C) 比例達97.62%；該基因組編碼16,257個基因，目前獲得功能注釋的基因總數達14,189（總注釋率87.28%）。

　　白肉靈芝原產於中國西南川藏高原地區的重要靈芝種類，為靈芝複合種（G. lucidumcomplex）的新成員。2016年，我院蔬菜所開始在西藏林芝地區的白肉靈芝示範基地進行段木種植與代料袋栽試驗，選育得到H4等栽培菌株。2021年11月，廣東省微生物研究所發表了第一個白肉靈芝單核化菌株DH-8的單倍體基因組，序列總長為50.05Mb，由58條Scaffolds構成，預測到13,390個基因，基因組BUSCOs完整率為96.55%，（https://doi.org/10.1093/g3journal/jkab337）；NCBI數據庫顯示該基因組大小為49.523Mb（GenBank: GCA_020736865.1），相當於本研究完成的白肉靈芝基因組的單倍體長度49.2Mb（Genome Scope評估）。本次合作完成的白肉靈芝基因組為後續開展中國栽培靈芝的比較基因組學分析與白肉靈芝特有基因家族的挖掘與利用奠定基礎。