近日，動衛所在國際期刊Animals（中科院大類二區）發表了題為“Emergence of a Novel G4P[6] Porcine Rotavirus with Unique Sequence Duplication in NSP5 Gene in China”的研究性論文，揭示了豬A群輪狀病毒（porcine Rotavirus A，PoRVA）的遺傳多樣性與潛在的豬與人RVA基因重配現象，拓展了對RVA基因組學的認識。動衛所豬病研究室周霞博士為論文第一作者，動衛所豬病研究室翟少倫研究員和新疆畜牧科學院獸醫研究所魏玉榮研究員為論文共同通訊作者。

輪狀病毒（Rotavirus，RV）是一種引起幼齡動物和嬰幼兒急性腸胃炎的人獸共患病病原體，特別是在發展中國家，每年可造成約45萬名5歲以下兒童死亡。豬輪狀病毒（Porcine rotavirus，PoRV）是引起仔豬病毒性腹瀉的主要病原體之一，仔豬感染PoRV後迅速發生腹瀉，嚴重者常常因脫水而死亡。RV由11個分段的RNA片段構成，分別編碼6個結構蛋白（VP1、VP2、VP3、VP4、VP6、VP7）和5或6個非結構蛋白（NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5/6）。其中，大多數NSP5基因片段的長度約為667 bp，大於667 bp的NSP5基因片段非常罕見，特別是在中國，到目前為止，國內僅報道了一株兔RV G3P[14]毒株（N5），其NSP5基因片段含有946個核苷酸。

該研究團隊利用病毒全基因組測序和生物信息學方法，在廣東省的一頭患腹瀉仔豬中鑒定出1株具有較長NSP5基因的PoRVA獨特毒株，命名為RVA/Pig-tc/CHN/S2CF/2023/G4P[6]，完整基因型為G4-P[6]-I1-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1，該毒株在NSP5基因的3’末端非編碼區存在一段含有344個核苷酸的重複序列。同時，還發現該毒株的11個基因片段中有4個（VP4、VP6、VP2和NSP5）基因片段的核苷酸相似性與人源輪狀病毒最高，表明豬與人輪狀病毒之間存在潛在的種間傳播。RV基因序列分節段的特性是導致新毒株出現和種間傳播的重要原因，因此，文章再次提出了對RV的11個片段進行基因組分析的必要性，以便為RV的種間傳播和溯源提供重要的理論基礎。

圖1. S2CF毒株NSP5基因重複序列插入位點示意圖

本研究得到了必威betways “金穎之光”項目、新疆動物疫病研究重點實驗室項目、廣州市重點研發項目、廣東省畜禽疫病防治研究重點實驗室項目和廣東省農業農村廳項目等資助。

原文鏈接：https://www.mdpi.com/2076-2615/14/12/1790