動衛所科研人員在豬新發病原—蓋塔病毒鑒定方麵取得新進展
近日,動衛所科研人員在國際期刊Microbiology Spectrum(中科院大類二區)發表題為“Emergence of a novel GIII Getah virus variant in pigs in Guangdong, China, 2023”的研究性論文,該研究從廣東省某發病豬場分離鑒定了一株蓋塔病毒,並進行了全基因組測序和生物信息學分析,發現該病毒株屬於GⅢ基因型。動衛所豬病研究室楚品品、複旦大學郭宏元、動衛所豬病研究室周霞等為論文共同第一作者,動衛所豬病研究室翟少倫研究員和複旦大學張榮研究員為論文共同通訊作者。
發病豬臨床表現和蓋塔病毒GDHYLC23毒株分離鑒定
蓋塔病毒(Getah virus,GETV)隸屬於披膜病毒科(Togaviridae)甲病毒屬(Alphavirus),是一種由蚊蟲傳播的蟲媒病毒,可在蚊子體內增殖並通過叮咬傳播給宿主動物,感染了GETV的宿主動物又成為傳染源被未感染蚊子叮咬,又傳回蚊子,形成“蚊子-宿主動物-蚊子”的循環模式。蓋塔病毒宿主範圍廣泛,目前發現的潛在感染宿主動物高達19種,甚至在人類中也檢測到GETV中和抗體的存在。蓋塔病毒感染宿主豬後,主要臨床表現為發熱、腹瀉和繁殖障礙,嚴重時甚至引起患病仔豬死亡。近年來蓋塔病毒引起豬病相關報道持續增加,給養豬業造成巨大的損失。
蓋塔病毒屬於RNA病毒,其核酸為單股正鏈RNA,基因組由5′非編碼區、兩個開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF,ORF1和ORF2,分別編碼非結構蛋白和結構蛋白)和3′非編碼區組成,其中3′非編碼區極少出現連續堿基的缺失或插入。本研究從發生母豬流產,發情異常,腹瀉,新生仔豬體溫過低、水腫、共濟失調和死亡的豬場分離到一株豬蓋塔病毒,命名為GDHYLC23,並利用病毒全基因組測序和生物信息學方法,獲得病毒全基因組並對其進行分析,結果顯示該病毒株屬於GⅢ基因型,序列比對分析發現在其緊臨ORF1的3′非編碼區處存在一段較長插入,長度為32bp,該片段插入目前尚未見報道。該毒株的發現拓展了對豬蓋塔病毒多樣性以及變異性的認知,為引起相關豬病的研究奠定了基礎。
GDHYLC23毒株3′非編碼區序列比對分析和基因組遺傳進化樹
本研究得到國家自然科學基金項目、廣東省重點領域研發計劃、必威betways 項目、上海市重大科技專項項目、上海市優秀學術帶頭人計劃和廣東省農業農村廳項目等資助。
原文鏈接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.00483-24