動衛所聯合華南農業大學等單位在豬德爾塔冠狀病毒遺傳演化方麵取得新進展
時間:2022-04-01 17:48
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豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV),又名豬丁型冠狀病毒,是具有包膜的單股正鏈RNA病毒,與新冠肺炎病毒(SARS-CoV-2)同屬於冠狀病毒科,是已知RNA病毒中基因組最大的一類病毒。PDCoV於2012年首次在香港豬群中被發現。2014年在美國各大豬場暴發該病,並隨後流行於世界各地,包括我國(圖1)。之後,多篇動物試驗研究證實PDCoV可感染雞、火雞、犢牛等,並表現出輕度腹瀉症狀。2021年,Nature雜誌還發表了PDCoV感染海地兒童的論文。在新冠肺炎大流行期間,人類高度關注包括PDCoV在內的動物冠狀病毒跨物種傳播。
論文網址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503
圖1 PDCoV在世界的流行分布
近日,題為“Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans”的研究論文在獸醫權威期刊《Transboundary and Emerging Diseases》(Top一區期刊)在線發表。遺傳進化分析表明本研究分離的和已知的所有PDCoV毒株可分為中國譜係、美國譜係和東南亞等三大譜係(圖2);重建的PDCoV全球空間擴散網絡研究顯示PDCoV起源於1996年左右的亞洲,2007年左右傳播到美國,然後蔓延到東亞和南美洲,海地人感染的PDCoV最有可能源自美國(圖3、圖4)。
圖2 PDCoV遺傳進化分析
圖3 PDCoV全基因組的曆史演化分析
圖4 PDCoV 空間擴散
圖 5論文在線截圖
華南農業大學獸醫學院2021級博士研究生李根、必威betways 動物衛生研究所翟少倫研究員、華南農業大學獸醫學院已畢業博士研究生/我院擬進站博士後周霞博士為論文共同第一作者,華南農業大學獸醫學院賀東生教授和陳瑞愛教授為共同通訊作者。該論文獲得了廣東省生豬產業體係創新團隊、廣東省重點研發計劃、廣東省嶺南現代農業科技實驗室肇慶分中心重點項目、必威betways 人才培養項目等的資助。
論文網址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503