近日，果樹所優稀水果研究團隊在國際學術期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry（中科院農林科學一區TOP，IF=5.7）發表題為“Identification of Key Genes Controlling Sugar and Organic Acid Accumulation in Wampee Fruit (Clausena lansium) via Genome Assembly and Genome-wide Association Analysis”的研究論文。果樹所為論文第一單位，果樹所陳慧瓊博士為論文第一作者，果樹所陸育生研究員和北京大學現代農業研究院郭立研究員為論文共同通訊作者，團隊成員參與了相關工作。

　　我國是世界黃皮遺傳資源最多、栽培麵積最廣和產量最高的國家。黃皮果實營養豐富，具有抗氧化、防衰老、抑腫瘤等功效，是少有的藥食兼用型水果，深受消費者的喜愛。果實風味是決定果樹品種的大眾接受度的關鍵因素，而果實糖酸含量是影響果實風味的主要因素。

　　本研究首先利用三代測序技術和Hi-C組裝技術對金豐黃皮基因組進行組裝，得到染色體水平的黃皮參考基因組，其大小為284.15 Mb，在Hi-C測序的輔助下，93.83%的組裝序列被錨定到9條假染色體上，contig總長297.1 Mb，scaffold總長為297.1 Mb。本研究接著對266份黃皮核心種質進行重測序，通過選擇印跡分析與全基因關聯分析發掘到調控黃皮果實糖酸的關鍵轉錄因子ClERF061和糖轉運蛋白基因ClSWEET7，ClERF061和ClSWEET7表達水平和果實糖酸積累顯著相關，並初步驗證ClERF061具有激活下遊靶基因ClSWEET7啟動子的功能，推測它們可能共同參與了黃皮果實糖酸積累的調控。本研究有助於深入了解黃皮果實糖酸品質形成的生理與分子機製，為培育適當糖酸比例、風味好的黃皮品種提供理論依據和基因資源。

　　該研究得到了廣東省鄉村振興戰略專項（2024-NPY-00-032；2023-NBH-00-004），必威betways 優博項目（R2021YJ-YB3022），廣東省現代農業產業技術體係創新團隊（2022KJ116,2023KJ116），廣州市科技計劃項目（2023A04J0141）等項目的資助。

　　原文鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.4c04830

選擇印跡分析與全基因關聯分析發掘調控黃皮果實糖酸的關鍵基因