根據2019年11月15日基本科學指標數據庫（Essential Science Indicators，簡稱ESI）最新公布的ESI學科排名數據，我院有2個學科（“農業科學”和“植物與動物科學”）進入了ESI前1%。另外中國農業科學院9個學科、北京市農林科學院2個學科、江蘇省農業科學院2個學科、山東省農業科學院2個學科、浙江省農業科學院2個學科、中國熱帶農業科學院2個學科、中國水產科學研究院2個學科、貴州省農業科學院1個學科進入ESI前1%。
2018年5月，我院“農業科學”學科首次進入ESI前1%，排名為747。2018年11月，我院“植物與動物科學”首次進入ESI前1%，排名為1188。根據2019年11月最新數據，我院“農業科學”和“植物與動物科學”目前在ESI前1%的排名分別為663和1095，較首次進入排名時分別提高了84位和93位，提升較大。
最近2個月，我院在“農業科學”學科排名中上升14位，上升速度僅次於中國熱帶農業科學院（上升17位），居第二；在“植物與動物科學”學科排名中上升8位，上升速度僅次於江蘇農業科學院（上升16位）和浙江省農業科學院（上升11位），居第三，上升速度明顯。
ESI是由世界著名的學術信息出版機構ISI推出的衡量科學研究績效、跟蹤科學發展趨勢的基本分析評價工具，是基於ISI引文索引數據庫Science Citation Index （簡稱SCI）和 Social Science Citation Index（簡稱SSCI）所收錄的全球8500多種學術期刊的1000多萬條文獻紀錄而建立的計量分析數據庫。科研機構的排名主要參照指標為總被引次數（Citations）、論文數（Papers）和篇均被引次數（Citations Per Paper）。我院“農業科學”和“植物與動物科學”兩個學科在ESI排名數據的進步，說明“十三五”以來我院科學研究不斷深入，科技論文水平有較大提升。